珠海检验检疫局承担着对珠海口岸出入境人群的艾滋病监测工作，根据我国《卫生检疫法》及其实施条例等有关规定，外国人在我国居住一年以上的，我国公民欲出境一年以上的或出境三个月以上回国的，必须到国际旅行卫生保健中心进行体检，办理健康证。出入境交通员工由于频繁出入境，也必须进行体检，办理健康证，健康证有效期为一年。在体检中，艾滋病感染检测是一个必做项目。
拱北口岸 “一站式”客车查验系统将出入境交通员工的健康证信息纳入查验系统，有效强化了对艾滋病等传染性疾病的监测工作。在尚未开通“一站式”查验系统的横琴口岸，珠海检验检疫局加强对交通员工的健康证查验工作，热情提供健康咨询服务，督促按时进行健康体检。
珠海检验检疫局一直重视艾滋病检测能力建设，该局国际旅行卫生保健中心艾滋病检测实验室不断提高检测水平，是全国质检系统11个艾滋病检测确认实验室之一，也是珠海市最早通过卫生部确认的艾滋病检测确认实验室。
